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尽管研究表明服用益生菌可以减少抗生素对胃肠道的副作用，但对于服用益生菌和抗生素是否也可以保持肠道微生物的多样性和组成存在争议。一些医疗保健专业人员不愿意将益生菌与抗生素一起推荐，因为担心会进一步改变患者肠道中微生物的微妙平衡。

科学家们刚刚在医学微生物学杂志上发表了一篇新论文“将益生菌添加到抗生素干预对人类肠道微生物多样性和组成的影响：系统评价”，他们说他们的工作提供了第一个系统评价来评估服用益生菌和抗生素对人体肠道微生物组多样性和组成的影响。该评论由来自TecnológicodeMonterrey医学与健康科学学院、德克萨斯大学和德克萨斯基督教大学的研究人员撰写，评估了过去七年发表的29项研究的趋势。

作者的目标是评估添加益生菌是否能够恢复在接受抗生素治疗的成年参与者中常见的α多样性和肠道微生物组成的变化，他们发现将益生菌与抗生素一起服用可以预防或减轻一些抗生素引起的肠道微生物变化。肠道微生物组成。益生菌还可以帮助保护物种多样性，甚至可以恢复一些友好细菌的数量，例如Faecalibacteriumprausnitzii，它可以减少炎症并促进健康的肠道屏障。

“共有29篇文章(n=11种抗生素，n=11种益生菌，n=7种抗生素+益生菌)符合纳入标准。缺乏标准化的肠道微生物组成分析方案和广泛选择的抗生素/益生菌使数据解释复杂化;然而，尽管存在这些差异，益生菌与抗生素的共同给药似乎可以防止部分(但不是全部)抗生素引起的肠道微生物多样性和组成变化，包括普氏梭菌等与健康相关的细菌的恢复。

“在抗生素干预中添加益生菌似乎可以保持α多样性并改善抗生素干预引起的肠道微生物组成的变化。”

“尽管我们还没有对什么是健康的肠道微生物组给出一个单一的定义，但我们在健康人身上观察到的一件事是，他们在肠道中具有更高水平的多样性和更多种类的细菌，”得克萨斯基督教大学助理教授、该论文的合著者ElisaMarroquin博士解释道。“当参与者服用抗生素时，我们看到一些细菌种类发生了一些一致的变化。但是当治疗与益生菌相结合时，这些变化中的大部分就不那么明显了，有些变化被完全阻止了。考虑到目前可用的人类数据，似乎没有理由在开出抗生素处方时拒绝开出益生菌处方。”